今、何を優先的に実行すべきかお教え下さい。

私は「フォロワーシップ」といって、簡潔にいうと上司をどうマネジメントするかというような研修プログラムを実施していますので、その観点で少しアドバイスさせて下さい。

まず社員の皆さんからすると、「経営者は本来は率先垂範すべきなのに、サボってばかりで仕事をしないし、約束も守らない。こんな社長のもとではやってられない。」という感じなのでしょう。
確かに経営者としては大いに問題アリですね。

ではその社長さんに、どうなってもらうのがベストなのでしょうか。
毎日きちんと会社に来て、的確に一貫した指示をして、いつでも報告、相談ができること、なのでしょうか。
もしそうなったとすると、現場は意外に息苦しいのではないでしょうか。

御社のようなオーナー経営者の会社では、社長がいないと現場が回らないところが多いですが、社長がいなくても日々の業務が回っていくというのは、逆に強みですばらしいことだと思います。どうせなら、現場の事はさらに全面的にまかせてもらえるように仕向けてみてはどうでしょうか。

社長ももしかすると少しはやましい気持ちがあって、仕事に関与しなければと中途半端に指示を出しているのかもしれません。ならば「その辺りは任せてください」と言ってしまっても良いのではないでしょうか。
もちろん、必要最低限の報告、連絡、相談は必要でしょうから、その辺りの約束事は必要かもしれませんが、報告や相談もメールや電話で可能なら、それで良しと割り切ってしまってはどうでしょう。
会社の方向性も、社員同士で話し合って、「こんな方向性でやりたい」と提案してみてはどうでしょう。

…ときれいごとを述べましたが、現実はなかなか難しいのかもしれません。
ただ、経営者は親ではないですし、人格者であることもそれほど多くはないです。
例えば「自分たち社員に、仕事と生活の場を提供してくれるスポンサー」などと考えて接してみると、社員の皆さんの感じ方も少し変わるような気がしますが、いかがでしょうか。

justdoit0612さま。初めまして、北海道旭川市で行政書士をしている小林と申します。

いろいろお疲れのことと思います。

また、真面目な同僚さんに恵まれたようで何よりです。

そちらの会社では会社の人間が一堂に集まるような会議や宴会は無いのでしょうか？

無いのであれば、職員からの希望として社長夫婦に開催を提案してはいかがですか？

社長がいなくても会社が回るから社長が来なくなるのです。

社長以下社員がみんなで会社のために話し合う機会を持てば、社長も社員も情報を共有できようになり、社長も会社に来やすくなるのではないでしょうか？

そちらの会社では社員の誕生日などにプレゼントを贈るようなイベントはしていますか？
あるいは社員から社長に誕生日プレゼントを贈るようなイベントをしたことはありますか？

子供を大切にする社長のようですから、社長の子供の誕生日に社員からプレゼントを送ればそれが高価なものでなくても、社長夫婦は喜ぶのでないですか？

そうやって距離を縮めてみてはどうですか？

悩むところですね。私も経営者の端くれとして、このようなことをしないよう、justdoit0612さんの社長を反面教師として、自分を律していかねばなりませんが、まぁ未熟なが多く、まだまだ勉強修行は続いていますし、一生かな？と感じています。
それはともかく、相手の性格というものは、変えることは容易ではありません。むしろ「出来ません」といった方が正解かもしれません。
それだけでは、お答えしたことになりませんから、私なりのご意見でお話させて頂きます。
もうそういった人なんだ、ということでこの人（社長）を受容れた上で、自分がそれを補佐していくにはどうしたらいいか？と常に年頭にお考えになられてはいかがでしょうか？
一時期、ある方が幹事長だった頃、「神輿とバカは軽いほうがいい」と発言して物議を醸したことがありますが、トップが凡庸だったり、少々劣る能力を有している場合、優秀な補佐役が必要不可欠なのです。
逆にトップがあまりにも頭がよ過ぎてしまうと、自分で何でも出来てしまうので、部下が何でこんなこと出来ないんだ！！という思いでいっぱいになり、社員を育てられなくなります。ということは、その会社は必然的に衰退の道をたどります。
ですので、ご自身が中心となるなりして、何処の部分が問題があるのかを見つけ出し、一つ一つ地道に洗い出したうえで、改善していくしかないと思います。簡単なことではないと思いますが、ご自身ならきっとやれると思われます。