育児休暇について

まずは「おめでた」良かったですね。おめでとうございます。元気なお子さんを授かりますように。

さて、“従業員とは契約社員も含む”という記載があり、基本的な有給休暇などの条件は正社員・契約社員共同じというのであれば問題無いと思います。
産休に関してのみ例外で正社員になってからの期間を対象とするというのではかなり無理がある解釈でしょう。
加えて、産休（産前・産後）に関して特に入社年数について記載が無いのであれば、大丈夫でしょう。

契約社員として２年の実績があり正社員になられたということは、会社からも必要とされている人材と想像致します。
ある程度仕事ができる人材は「復帰」してほしいと思われるものです。

ただし、いきなり「就業規則によると．．」と切り出すのは得策ではないと思います。
そのようないわゆる「法律論」的な事を言う人は上司からすると「可愛いげない」ものです。
切り出してみて難色を示された時に初めて「こう書いてありますので私の解釈は...ですが、いかがでしょう？」という感じで話されてみてはいかがでしょう。

はじめまして、社会保険労務士の小島です。

確かに、ご心配になるお気持ち、察します。
ただ、育児休業は取れますので、ご安心下さい。

本件、育児・介護休業法第６条に答えが書いてありますが…。
「事業主は、労働者からの育児休業申出があったときは、当該育児休業申出を拒むことができない。ただし、労使協定で定めた次の者は除外できる」とありまして、
１．当該事業主に引き続き雇用された期間が１年に満たない労働者

となっています。就業規則はここを受けたものになっています。
ただし、よく読むと、引き続き雇用された期間が１年に満たない、となっておりこれは、同一事業主に雇用された期間のことです。要は、その事業所に雇入れられてから１年を経過していない者ということになります。

ということは、契約社員の期間も通算するという意味です。
したがいまして、今お考えの理解で正しいのです。
産休についてもその通りです。

以上、回答申し上げます。