契約解除・手付金返還は難しいでしょう

　はじめまして。司法書士の井本と申します。

　せっかくのマイホーム建築という素晴らしいイベントがご質問のような状態になり、心中お察しします。

　まず、ご相談者様の希望は以下のとおりと整理します。
　　１．契約を解除する。
　　２．手付金を返還してもらう。

　細かい部分については不明なので、大まかな判断を述べます。

　まず１の契約の解除について
　今回のケースは完成した土地付一戸建てを購入する本来の建売とは違い「土地の売買契約と建物の建築請負契約」ですね。
　で、この手付金はおそらく「土地の売買契約」の解約手付金だと推察します。

　であれば、「土地の売買契約」の解約については民法557条に「買主が売主に手付を交付したときは、当事者の一方が契約の履行に着手するまでは、買主はその手付を放棄し、売主はその倍額を償還して、契約の解除をすることができる」とあり、相手が売買契約の履行に着手しているかどうかが解除できるかどうかの判断となりそうです。

　「建物の建築請負契約」は第641条に「請負人が仕事を完成しない間は、注文者は、いつでも損害を賠償して契約の解除をすることができる。」とあり、第635条にも「仕事の目的物に瑕疵（キズ、問題箇所）があり、そのために契約をした目的を達することができないときは、注文者は、契約を解除することができる。」とあります。
　しかし、635条には但書きがあり、「ただし、建物その他の土地の工作物についてはこの限りでない」と建物や土地の定着物では契約を解除できないと受け取れる但書きがあります。

　この場合、今回お話の「建物の基礎」が「土地の工作物」に当たるので、契約の解除はできないということになります。
　この場合に請求できるのは「瑕疵の修補」のみということになります。
　しかし姉歯事件以降、このあたりの解釈も変化してきています。
　ですから今回の場合「建築確認」をおろした行政庁に、「本当にこの建物は建築確認どおりに施工がなされているのか」ということをご相談なさってはどうでしょうか？
　中間検査まで待っていては遅いということも説明すればよいと思います。
　また、そういったことも考慮していることを不動産業者に匂わせて、ちゃんと補修してもらうか、もう一度基礎をやり直してもらう請求もできるかもしれません。