現地調査しなかったハウスメーカーの責任は

以前質問をさせていただきましたが、進展に伴って再度相談いたします。
登記と現地の面積に差異があった（現地の面積の方が３坪程少なかった）ことに伴ってのことですが、土地に関しては売主が開発時の登記ミスを認め、土地減少分＋補償金という形で誠意を持って対応してくれているため、そのまま購入する方向で考えております。
今の問題は、某大手鉄骨ユニット系ハウスメーカーとの交渉です。
メーカーでは登記上の現地測量図をベースにプランニング〜着工に至っており、現地での測量（簡易的なものも含めて）はやっておりません。
結果、着工後、基礎固めの段階、ユニット上棟10日前に発覚し、現在に至っております。
着工前に差異が判明していれば、プランのやり直しができたという思いからメーカー側の責任もハッキリさせておきたいのですが、どの程度要求できるものか改めてお伺いします。
今検討している優先順位としては
１ プランニングからのやり直しを求める。
２ 契約解除（一度白紙にしてメーカーの選定から仕切り直し）
３ 金銭的な補償で現在のプランを継続する。
建物自体が土地に入るということで、メーカー的には、「３」の方向で進めたいようです（補償も微々たるもののようです）。１，２に関しては裁判の可能性（一応、土地の売主に対してと言ってますが、契約上はこちらが対象になるような気がするのですが）も仄めかされています。
メーカーとはこの事態が発生してからも友好的に話してきたので、もめたくはないのですが、責任をうやむやにしてまでという気にはなれません。
土地の状況を把握せずに建築確認申請、着工ということに対する責任というのはどの程度のものなのでしょうか。土地が解約となれば、建物も当然解約ということで筋は通ると思うのですが、土地の購入価値があるために非常に悩んでおります。
よろしければアドバイスお願いいたします。