妻が個人事業主の場合の年末調整

はじめまして。今年からSOHOでWeb制作をしています。
夫はサラリーマンです。
私は個人事業主として青色申告をしています。

年末調整の書類を書かなくてはいけないということで、収入を聞かれましたが、この収入とは年収のことでしょうか。それとも所得のことなのでしょうか。
夫に内容の詳細を聞いたのですが、今ひとつ的を得ず、書類もPCから直接入力するから持ち帰れないとのことです。

私は複数の企業・個人から成果報酬で仕事をしています。源泉はひかれたりひかれなかったりと企業により、まちまちです。
年収は12月までの見込みで80万（源泉分込み）前後になります。
今年は初年度ということでソフトや機材の購入などでお金がかかったため、経費を引くと10万近い赤字です。
この場合、今年の配偶者控除は受けられると思うのですが、年末調整の書類への記入は妻の収入は０として書いて良いのでしょうか。
また、夫の会社から扶養手当として月1万8千円が給与にプラスされています。この扶養手当は私の収入になにか影響するものですか？


来年度は経費がぐっと少なくなると思うので、所得が増えると思います。
収入−経費−今年の赤字分（10万）−青色申告の控除（65万）で、38万以下の場合にはまだ扶養に入っていられるのでしょうか。
できればバリバリ仕事をしたいと思うのですが、仕事に波があり、収入が毎月まちまちです。扶養をはずれる上手いタイミングなど、アドバイスがありましたらぜひお願いいたします。