育休後、定時（9～6）勤務してるのに残業できないと時短扱い？

社員として働く自社についてです。
2年前から1年ほど産休～育休をいただき、去年の4月から別部署に転属しての復職となったのですが、3月の評価時期になり他の従業員と比べて残業が少ないから会社に貢献していない、だから評価は最低だと言われ、次の4月から更生プログラムというものを課せられ、再度転属することになりました。

そこで疑問なのですが、復職時に残業ができないことを了承されており、実際は月20時間程度の残業をしている中でも、会社に「月給40時間分の残業代を含む」という規定があると、40時間は残業をしなければならないということになるのでしょうか？
また、子供の病気などで、月に数日有給をとることがあったのですが、有給取得分は勤務時間にカウントされていません。
会社の言う160時間+40時間＝200時間働かなければならないということは、例えば実稼働日数が17日/月でも200時間は働かなければいけないということなのでしょうか？

毎月40時間残業することは現実的に厳しいですが、みなし残業分をカットすると元の給与の2割減となってしまいます。
残業代は払うということになったとしても、裁量労働制なので、どういう計算で支払われるのかも疑問です。

もしその理論が通るのであれば、転属先でも同じことが繰り返される恐れがあります。
また会社の「評価１」というのは、更生が必要なレベルと定められているので
繰り返された場合、減給や最悪解雇もやむなし、を認めることになってしまいます。
定時+若干の残業もしているのに理不尽だと感じていますが、法的には問題ないのでしょうか？
もし詳しい方がいらっしゃいましたらアドバイスをお願いできればと思います。