繰り上げ返済を中心に考えていいでしょう

えいなさん、はじめまして。
ＦＰの栗本と申します。

突然の大きな収入に戸惑われる気持ち、よくわかります。ここは、あわてずにゆっくりと将来の計画を考えてみましょう。

まず、現状の家計の中でも毎月12万円（子供貯金3万、予備費4万、財形5万）の積立ができているようですので、現在お持ちの貯蓄と収入がupした分を加えられれば、今後の家族に起こりうる様々なイベントには十分対応できるように思います。

これを目でみて確認できるように、キャッシュフロー表を作られることをお奨めします。

そして今回の退職金の1000万円ですが、お考えの通り住宅ローンのボーナス部分（約600万円）の返済にまわされ、残りを手元に残すというのがベターな選択かと思います。

理由として、住宅ローン控除で今後6年間に戻ってくる税金より、一括返済をすることでなくなる利息の支払いの方が多いと考えられることが上げられます。

住宅ローン控除は、居住した年によって違いがありますが、残債の1％というのが上限です。現在約1682万円とのことですから約16万円程度です。仮にこの金額が後6年続いたとしても96万円。実際には残債は減りますし、控除率も低くなりますから、これより少ない金額となります。

一方、ボーナス払いで今後支払う金額は「42万円×残り返済期間」ですよね。ローンの返済期限がいつかはわかりませんが、仮にあと25年残っているとしても1050万円の支払いになり、それを600万円の繰り上げ返済で返せるとなると約400万円ほどの利息支払がなくなる計算になります。（この数字はご自身でご確認下さい）

もしもの時の貯金を残されたい気持ちもよくわかりますが、繰り上げ返済に使わない400万円と現在の貯蓄をあわせると約975万円ほどになりますので、手元においておく金額としては十分だと思いますよ。

運用手段まで回答が追いつきませんでしたのでまた必要であればご質問ください。