別素材が良いと思います。

こんにちは。東京城南地区の住宅をメインに活動しております、設計事務所：クロノグラム　アーキテクトスタジオの葛原と申します。宜しくお願いいたします。

お悩みの内容良く理解できました。アドバイスさせて頂きますと答えは
「別素材をお薦めいたします。」となります。

お考えの様に”似て非なり素材”では継ぎ接ぎ修理的な雰囲気になってしまいます。

具体的な素材としましては
タイル、コルクタイル、畳、カーペット、塩ビタイル、大理石などが挙げられます。
※タイルはINAXより、一般のタイルに比べ保温性がある「サーモタイル」というものもあります。
※コルクは神戸コルクが有名メーカーです。
※タイルや石は豪華さや品格があって掃除も楽で良いのですが、素足では足腰がつかれます。犬猫にも良くありません。

洋室側の用途や使い方の記述がありませんでしたが、
ソファセットやTVを置く
ダイニングにする
ペット（熱帯魚）がいる
子供の遊び場にしたい
赤ちゃんのお昼寝やゴロゴロ出来る和室にしたい
床暖房を組み込みたい
ピアノを置きたい
勉強や作業のためのデスクコーナーを設けたい
ホームシアターにしたい
明るい素材にしたい（光の反射具合の配慮）
落ち着いた色・素材にしたい
などなど

工事上は、素材の厚さが既存フローリングと違う場合の処理や見切りの仕方などを考慮する必要があります。

見た目の完成イメージと合わせて、用途や使い方やご予算などを絞り込むことで素材が決まってくるのではないかと思います。
また、天井や下がり壁の処理も必要になったりしますね。

※ホームシアター設置やテレビの移動、照明の変更などがありますと電気関係の工事も必要になる場合がありますね。

仕上げ材の張替えや設備の取替えだけのリフォームは業者さんだけでも可能ですが、空間造りを伴う場合は設計事務所やインテリアコーディネーターにご相談くだされば、デザインや雰囲気、使い勝手、コストパフォーマンスの良い空間が出来上がると思います。（お住まいの地域によっては当事務所でも可能です。）

快適なお部屋になると良いですね。