WEB業界のキャリア構築と転職の際の市場価値について

こんにちは。現在情報系大学院で学んでいる大学院修士2年の女です。大学学部時からWEB・IT業界でキャリアを築きたいと思い大学院へ進学し、今春からメーカー系のIT・WEB教育関連の会社で就業することが決まっております。

しかし、本来の希望は規模の大きい事業会社での自社運用のWEB関連の仕事（ECサイト・ポータルサイトなどの企画・運用など）につくことでした。就業予定の会社も、少しでも希望に近付ければと選びました。
そこで、そのような仕事にIT・WEB教育（インストラクターやe-ラーニング）から就くには何をすればよいのか、また転職市場ではどのように見られ、希望する仕事に今後就けるのか転職できるのか、意見を伺えればと思い、相談しました。

もちろん就職活動時、自社運用のWEB関連の仕事に就けるように活動していました。しかし新卒採用では、規模の大きい会社ほど総合職採用やSE採用が多かったりして希望に合わず、かといってWEB関連専門の会社は力及ばず内定に至らなかったり、あるいは規模が小さく就業に不安があるなどの理由で、上記のような会社を選んだ次第です。

私はIT・WEB教育事業の会社が、求めるキャリアに一直線ではなくてもマイナスになるとは思っていませんが、専門家の方から見てどうなのでしょうか？（転職サイトなどを拝見しますと求める職種には「WEBサイト構築経験」「運用経験」などの条件が見られ、かなり言語（php,javascript,html）やデザイン経験など細かく設定されていますので、そちらの力をつけることを優先したほうがよいのでしょうか？

ご意見伺えればと思います。よろしくお願いいたします。