繰り上げ返済と頭金の優先順位について

主人 40歳 会社員 年収 700万 （+家賃収入114万）
妻（私）36歳 専業主婦 子供 2人（3歳＆0歳）


1、2004年11月に投資用マンションを購入しました。ローン1000万の20年変動（現3.875％）残債約830万。家賃年収 114万。

2、子供が生まれたこともあり、居住用住宅を購入する予定です。
土地 + 家 で2500万を予定しています。

そこで、自己資金500万のお金を1の投資用マンションの繰り上げ返済にあてたほうがよいのか、2の居住用住宅の頭金にあてたほうがよいか迷っています。

1はもちろん金利も高いので、そちらに支払ったほうが気分的にはよいのですが、青色申告をしているため借入金利が経費算入できるので、ローンを残しておいたほうがいい気がします。

でも、2は住宅ローンの控除対象にもなりますし、金利も安い（労金で検討中、金利1.95％）。しかも長期優良住宅でさらに税金面が優遇されると聞きました。でも、それはどの程度のものか？よくわかりません。

また、土地と家でローンを別々にくみ（どちらも労金で2本立てとする）、自己資金を土地にあて、土地のローンを少なくし、家には自己資金をあてずにフルにローンをくむというようなことをすれば、税制面でのメリットを大きく活用できるのでしょうか？

さらにですが、税金面では住宅ローン控除だったか、長期優良住宅控除だったかが10年間適用されるとききました。それなら、ローンは長くくむより、適用される10年間にできるだけ近くしたほうが有利なのでしょうか？

以上ご回答宜しくお願いします。