地盤のことは設計者に任せたほうが良いと思いますよ。

補足

こなんさん。

地盤改良に1000万ですか。
「別業者」というのもひっかかります。

私が田んぼの真ん中で設計した鉄筋コンクリートの住宅は、建築面積が216平米（65坪）に対して、400万で杭地業を行ないました。（杭地業は地域差がかなりあるので、参考程度に）

「別業者」の地盤改良の仕様は、今回の設計者がチェックして、妥当と判断したのでしょうか。

私の経験では、杭もしくは地盤改良は上物の10％を超えないようにするのが、妥当な設計だと思っています。
それを超えないように、基礎方式や構造を決定していきたいところです。

こなんさんがどのくらいの規模の住宅を望んでいるかは判りません。敷地の状況も詳しくは判りません。

しかし、住宅の地盤に1000万かけなくても、他の方策があるように思えます。

その設計者に「設計料の増額の話よりも、別業者が提出した地盤改良が妥当かどうかの判断を聞きたい」と問うた方が良いのではないでしょうか。

敷地全体に、所定の地耐力を出すような地盤改良になってませんか？
もし、そうだとすると、設計は楽で、通常の設計と変わらなくなります。

「無駄にお金をかけないために、設計に手間をかけてもらう」のが筋で、「工事費が上がるから、設計料も上がる」のは筋が通りません。
設計料が上がるのは、あくまで余分に手間がかかるときのみです。