大丈夫です

空間スタジオの遠藤と申します。

少々情報が足りないのですが、分かる範囲で、想像しながらお答えします。

多分趣旨は「床組がなくて、火打ちも入っていないけれど、柱のねもとはしっかり固定されるか？」ということだと思いますが、結論は、大丈夫です。

基礎が立ち上がりも含め、きちんと施工されていれば、基礎の形は崩れることはないはずです。（地盤が悪ければそれは全く別のことになります）それに適切に土台がとめられていれば、土台がずれることはありません。従って床組がなくとも大丈夫です。（土台の腐れに関しては、別にご検討下さい）

すなわち、地盤を考慮し耐圧版ををきちんと施工しさえすれば4.5ｍ×6ｍのスラブが地上におかれる事になります。その長方形の形はまず変形することはありません。そこから適切に立ち上がりが外周廻りに施工されれば、その立ち上がりも変形しないはずです。コンクリートの四角いお盆のようなものが地面におかれたことになります。

その外周に土台がのるわけですが、きちんとアンカーが打たれていれば土台も動きません。ただし土台の継ぎ手の所は、両側にアンカーを打った方が無難です。

その土台の上に柱が立つのですから、柱の根元も動きません。

柱の上に、在来軸組で片流れの小屋を載せるわけですが、陸梁を飛ばす和小屋でしたら火打ちがいります。
登り梁をかけるのでしたら、構造用合板の野地板で固める方法があります。水平でない火打ち梁は仕口がうまくいかない場合が殆どですので、要注意です。

参考にして下さい。