今から計画すれば大丈夫です

sakura05さん、はじめまして
ファイナンシャルプランナーの京増です。

物件価格と頭金からだけでは、何とも申せませんが、現在の貯蓄額や年間の貯蓄額から見て、とても堅実な家計だと思います。
さらに、家計の見直しをするともっと節約できる部分もあるかもしれません。
しっかりと計画して、購入のタイミングや価格を明確にしていきましょう。

基本
住宅ローンの返済額を収入の２０％以下という考え方や、今の住居費（家賃）＋住宅購入目的の貯金額という考えかたがあります。
住宅取得にかかる諸費用としては、住宅取得金額のおよそ６％が必要になってきます。登記、税金、保険、新居のインテリア・家電、引っ越し費用などで250万円ほどは、用意しておくとよいでしょう。
4月の消費税増税にあわせて、すまい給付金や住宅ローン減税の控除額の拡大されていますので、どのくらい効果があるのか確認しておきましょう。
http://sumai-kyufu.jp/

今後の不安について
金利や消費税の他に、社会保険料の上昇などの外部要因の他に、子育て期間中なので教育費ことなど、家計の内部要因も考えなくてはなりません。
住宅ローンの返済は長期になりますので、今の生活をベースとして将来を予測しながら、計画することが重要です。

取得時期について
上のお子さんが年少で、小学校入学までにという希望なので、計画や準備する時間は十分にあります。

物件について
検討している物件が4000万円とのことですので、具体的な想定をして現在と購入後の家計がどうなるのかイメージしてみましょう
また、希望の地域での、通勤、学校、買い物などの住環境についても調べておきましょう。
さらに将来的に住み替えを考えているようでしたら、物件の価値が下がりにくいことも考慮しましょう。
計画段階では、ご主人の年収は基本給ベースとし、住宅購入後は就労希望とありますが、sakura05さんが働かなくてもやっていけるかというところから計画してみましょう。
また、住宅取得だけではなく、教育資金などライフプラン全体のバランスを考えながら計画してください。

これらをもとにして、住宅取得後のシュミレーション（住宅購入後の家計簿）してみましょう。

しっかりと計画して、安心してマイホームの取得がかないますように

※住宅購入をきっかけとした、ライフプランシュミレーションとコンサルティングサービスを提供していますので、ご興味がおありでしたら「この専門家に相談する」より、お問い合わせください。