直接施工業者に

ご回答ありがとうございます。
不信な点は全てHMは適当に言い訳し、心配なら検査してくれ、と言われました。
そして、打ち継ぎの部分が汚すぎて、手でカリカリ触ったら２センチ程の穴が掘れました。これは問題ないのでしょうか?
評価なのに質問してすみません。

打ち継ぎに時間がかかった様で、もしかしたら、コールドジョイントになってしまっているかもしれませんね。打ち継ぎ部分に穴があいているとなると問題があるかもしれません。

HMは、設計者が施主の為だけに働いてくれることが難しいので

　　　HMの社員なら会社の利益の為、
　　　HMに仕事を発注されている下請け設計者なら、
　　　元請けのHMの利益の為に働きます。
　　　つまり、お金を払ってくれる人の利益を優先します。

建築の素人の施主の方は、ある意味無防備です。専門的な知識等に関わることになると、素人を相手にしていることを最大限に利用する可能性もあります。

基礎の段階で、疑問や不安があり、それが解決できないということは、これからとっても大変になる（精神的に）かもしれませんね。

torichanさんの為に監理者として働いてくれる専門家（建築士）を雇うことが一番良いと、私は思います。その建築士は、弁護士のように、あなたの為に働いてくれる専門家です。

費用はかかります。しかし、住宅と言う、家族を守る建物が、本当に安心できる物である為には、施工者から独立し、しかも専門的な知識を持って監理するということは本来とっても必要で重要なことです。そのためには本来は必要な経費だと、私は思います。