会社分割などで実現可能です

事業を分けることが可能であれば，株式会社法上の「会社分割」を行うことが考えられます。例えば，ビルを所有し，１階部分でコンビニエンス・ストアを経営するとともに，２階より上の部分をテナントに賃貸している場合を考えてみると，新会社を設立してコンビニエンス・ストア経営事業を全て承継させ，既存会社にはビルの賃貸事業だけが残る方法で会社を分割することができます。新会社の株式は，既存会社が対価として受け取り，現物配当として株主に移転させるのが通常です。その結果，株主は，コンビニエンスストアを経営する会社とビルの賃貸事業を行う会社の２社の株式を持つことになります。このような方法は，「人的分割」「分割型分割」などと呼ばれます。具体的な手続としては，分割計画の作成，株主総会の承認，債権者異議手続，登記などが必要です。税務上は，「適格会社分割」として課税を繰り延べる方法があります。

ご質問の場合も，まずは会社分割を行い，その後にA家族とB家族との間で株式譲渡を行うなどすれば，A会社の株主はA家族のみ，B会社の株主はB家族のみという状態を実現することができます。A家族とB家族との間で後に紛争が生じないよう，利害関係を丁寧に調整しておくことが重要であり，それぞれ家族の相続問題も含め，全体的な事業承継を考えておくのが良いでしょう。また，会社分割にあたっては，取引先との関係維持や，雇用関係の整理，許認可の承継なども必要です。総合的な課税関係や，会社規模の縮小による影響も，事前に検討しておいた方が良いです。関係書類の作成や登記だけであれば司法書士でも対応可能ですが，税務上の問題もありますし，総合的な紛争予防という点では弁護士への相談や依頼を行っておくのが望ましいでしょう。