新築マンションのオプション工事について

盆栽迷人さん、はじめまして。竹内建設竹内と申します。
よろしくお願い致します。

ご質問の共用壁を、お隣との間仕切壁と想定しますと、おそらく鉄筋コンクリート造の構造耐力上重要な壁となっているかと思います。
そのような壁には穴をあけたり、欠き込みをするといったことはできません。構造耐力上、欠陥が生じることが予想されるからです。
ではどのくらいの穴なら影響が出てくるか、ご質問のように、釘を打つだけで影響が出てくるか、と言われますと、釘を打つ程度なら影響はないと考えます。

実際、施工中の段階ではそのような場面が出てきます。しかしそれには、壁の中に電気設備等の埋設配管がないか、確認しながら行います。
万一、釘を打つことで埋設配線、配管を傷つけることがあっても対応できる体制なので、できることです。
引き渡し居住後の段階では、それに対応できる体制ではないかと思います。
またコンクリート壁に釘を打つには、振動ドリルという機械を使って下穴をあけてからビスをねじ込むという流れになるので、結構な騒音になります。
内緒でこっそりねっ、というわけにもいきません。

想定の共用壁が、コンクリート造ではない場合
（石膏ボードで、壁を二重にしている場合もあります）
エントランス等共用部分に、共用の目的で行う場合
構造形式（壁式かラーメン構造か）
オプション工事の内容
等々によっても考え方は変わってくるかと思います。
クロスや塗装の補修等、構造体を傷めない補修なら別ですが、

共用壁には釘を打つことができない

と思います。