長引く根尖治療について

こんにちは。
右奥から2番目の歯の神経を抜き、根尖治療を始めて1年以上が過ぎてしまいました。
神経を抜いた時、歯に穴を2ヶ所開け薬を入れる治療をしましたが、暫く経っても噛んだ時の痛みが取れず、もう１ヶ所穴を開け薬を入れることになりました。
その後、痛みは軽くなってきたものも舌で歯を押したりした時の違和感は3ヶ月経ってもとれず、薬を入れ替えては様子を見るといった治療を何度も繰り返しました。レントゲンで確認した炎症部分も一端小さくなったものがまた大きくなったりで、レーザ治療も加わりました。
治療を初めて半年が経過した頃、炎症部分がほとんど消えていたので金属の土台を入れ仮歯を入れて様子を見ることになりました。
その間、長すぎる治療に不安を感じ、他の歯医者さんに1度見てもらいましたが、薬を根の先端まで入れなかったのがわからないと言われました。
元の歯医者に戻り、他の歯科で見てもらったことと治療に対する不安を話しました。
先端まで薬を入れなかった理由は、根の部分に負担があるからと説明を受けましたが、結局は金属の土台を外し前よりもっと深く薬を入れるという治療をやり直し様子を見ることになりました。
それから半年が経ち、だいぶ違和感もとれてきたので再び金属の土台と仮歯を入れることになりました。
しかし土台を入れた次の日からまた噛んだ時に痛みが出てきました。今は仮歯を外し土台だけで様子を見ている状況です。
今後良くならなければ、再び土台を外して薬の入れ替えをするかもと説明を受けましたが、歯へのダメージが心配です。
やはり根の先端まで薬を入れていなかった最初の治療方法に問題が合ったのではないかと思ってなりません。

神経を抜いたのが初めてな為、何もわからず不安でなりません。他の歯医者に変えた方が良いでしょうか？
良きアドバイスをお願い致します。