妻の親と同居です。将来の相続について不安です。

現在私が暮らしている住まいの土地と建物はどの様になりますか？

義両親というより、法律上は、義理の父と母に分けるべきでしょう。
そして、その不動産の名義人の方が亡くなった場合、例えばそれが義父ならば、遺産として、義母が2分の1、子らがそれぞれ4分の1ずつ相続します。

私達夫婦…（義親名義）土地+建物　/　嫁の妹…（義親の）預貯金
といった具合に綺麗に財産を分けられれば良いですが、
残した預貯金が極端に少なかったりした場合はどの様になりますか？

上記の相続割合で１共有状態の土地建物で、預貯金もすべて割合で分けることもできます。

しかし、それはお互いに不自由ですし、避けることが多いです。
その場合は、土地と建物に査定を取ります。

そして、２その査定額で、相手の取り分の割合を現金で払います。
大幅に預貯金が少なく不動産が高価だと、一括払いが難しいので分割にすることもあります。あるいはその土地を担保に借り入れして支払ったり。

また、３土地建物をすべて売って、お金を分けて引っ越すこともあります。

この１から３の形での解決を話し合って決めるのが普通かと思います。