お世話になります。
夫婦の共有名義で(結婚２５年)
毎月払う賃貸料(駐車場含めて)を考えて、この度建売新築住宅2900万円(諸費用別)を購入することになりました。

資金は貯金と両親からの援助を合算した現金決済です。
私は自営業でここ１０年継続して赤字申告、今年の申告も赤字です。
妻はパート勤めで90万円くらいの収入があります。

私の出す資金は貯金700万円、国債換金して500万円、計１２００万円。
妻の出す資金は貯金900万円、国債換金して500万円、計１４００万円。
援助は年金受給者の私の母から100万円(手持ちの現金)、
年金受給者の妻の母から200万円(手持ち現金)です。

私の資金１２００万円の内訳は
独身時代の預金約２００万円に、
1980年代後半から90年代バブル期に納税出来た期間においてそれなりに残した約５００万円で、
当時は預け入れ金利がよく１０年定期預金で約１．７倍に増えたため
元金７００万円が現在の１２００万円に至りました。

妻の資金￥１４００万円の内訳は
独身時代の預金約３００万円、親からの結婚祝い金１００万円、
私の仕事の専従者期間の1980年代後半から90年代バブル期に残した約４００万円で
当時は預け入れ金利がよく１０年定期預金で約１．７倍に増えたため
元金８００万円が現在の１４００万円に至りました。

上記のような資金繰りで住宅を購入した場合、登記記載の持ち分はどういった割合になりますか？
私２分の１、妻２分の１の割合で問題ないのでしょうか？
また持ち分の割合に支援分の資金割合も加味しなくてはいけませんか？
両親からの援助を合わせると私方の合計が１３００万円、妻方の合計が１６００万円で３００万円の差があります。
支援も私方よりも妻方のほうが１００万円多くもらいます。

購入後の不動産取得に関するの税務署からのお尋ねは、どういったものなのかよく解りませんが、
真っすぐきちんと回答しようと思っていますので
それも含めてた問題点、その他アドバイスをお聞かせ頂ければ幸いです。

お忙しい中恐縮ですが、よろしくお願いいたします。