こつこつがんばさん、初めまして。

初心者の構築したPHP＆MySQLによる会員制サイトの、将来的なリニューアルについてのご質問ですね。

サイトのリニューアルについて、およびリニューアルまでのサイトの運営について、留意点を何点かご説明したいと思います。

１．サイトのリニューアルについて
（１）ドキュメントの整備
自分でシステム構築をする場合ですと、開発用のドキュメントが整備されていなくても、開発や運用が可能かもしれませんが、将来、専門の会社に依頼することを想定するにあたっては、第三者が見てもシステムの概要や構造がわかるようにしておく必要があります。
システムの概要、機能要件、画面遷移図、データベース設計書、処理フロー図等のドキュメントの整備についてご検討ください。

（参考）IT情報局～中小企業のIT活用法　システム開発の仕様書テンプレートや参考サイトのまとめ
　　　　http://chusho-it.net/post_productdoc.html
　　　
（２）要求事項の整理
サイトのリニューアルをするにあたり、要求事項を整理しておく必要があります。
その際は、できるだけその要求を定量的に整理するのがベターです。
例えば、上記の例ですと「処理を高速化をはかる」とありますが、それはどの程度の高速化を目指すのか。
感覚的なものではなく、できるだけ定量化したうえで要求事項を整理したほうがよいでしょう。
（処理速度の例ですと、一般にエンドユーザーが業務としてシステムを利用する場合、ストレスを感じない画面遷移の時間は３秒以内といわれています。）
適正に定量化するには、いろいろな人の意見を集めることが重要です。利用者からのアンケート等の情報を元に、社内でご検討ください。

（３）業者の選定
会員登録が増えた段階で専門の会社に依頼するということですが、その際の業者の選定も留意が必要です。
開発費用は適正か、こちらの要求事項を満たす技術はあるか、同様のシステムの開発実績はあるか、等々を見極める必要があります。
開発費用に関しては、複数の業者に見積り依頼をして比較するのが良いと思います。その際には、上記（２）で整理した内容について、業者が正しく理解をしており、問題なく実現できる見込があるかを確認したほうがよいでしょう。
　　　

２．リニューアルまでのサイトの運営について
（１）データの定期的なバックアップ
登録・投稿したデータが消えるといった不具合をご心配されているようでしたので、データの定期的なバックアップをご検討されてはいかがでしょうか。
例として、「phpMyBackupPro」というツールをご紹介します。
phpMyBackupProは、簡単な設定でMySQLデータベースを自動バックアップしてくれるツールです。バックアップスクリプトをサーバーのcronに登録すると、定期的な自動バックアップも実現できます。
　　
　　　（参考）Web Tips　phpMyBackupProによるMySQLデータベースの自動バックアップ
　　　　　　　http://weback.net/php/1090/
　　　
（２）セキュリティ対策（webサイト診断等）
現在、webサイトのセキュリティや脆弱性診断サービスを行っている会社が多数あります。
費用はかかりますが、セキュリティ対策のため、そのような診断サービスの活用もご検討されてはいかがでしょうか。
また、情報処理推進機構では「安全なウェブサイトの作り方」としてウェブサイト開発者や運営者が適切なセキュリティを考慮したウェブサイトを作成するための資料を公開していますのでご参考までにご紹介します。

　　　（参考）情報処理推進機構　安全なウェブサイトの作り方
　　　　　　　https://www.ipa.go.jp/security/vuln/websecurity.html

以上です。
こつこつがんばさんのご活躍を心よりお祈りいたします。