pikarinkoさん、こんにちは。
インドからのスパイスの輸入と販売手続きに関するご質問ですね。

短い中にも色々な要素がある質問ですので、各要素ごとに少しずつ回答していきます。

・インドからの輸入
・種（植物）の輸入
・食品の輸入と販売
・ネット上での物品の販売

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・インドからの輸入
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まず外国からの輸入ですので、相手の国の貿易制度の影響を受けます。
インドの商工省商務局・外国貿易部というところが定める貿易管理制度では、輸出品を
[1]輸出自由品目(Free)
[2]輸出禁止品目(Prohibited)
[3]輸出制限品目(Restricted)
[4]輸出業者指定品目(Canalized)
の４つに別けています。
ほとんどのものは[1]に該当するようですが、輸入をご検討中のスパイスと種のチェックが必要です。
ジェトロに問い合わせてみるとよいでしょう。


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・種（植物）の輸入
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お気づきの通り、植物の輸入はチェックが厳しく輸出国と輸入国、双方での検疫が必要となります。
種だけでなく、加工済みのスパイスも検査の対象になります。
まず輸出国（インド）植物検疫機関が発行した「植物検疫証明書」を入手し、農林水産省植物防疫所に検査申請を行います。
まずは先方の販売者に検疫証明書を添付するよう依頼しましょう。

検疫の申し込みは、NACCSというシステムを用いればインターネット経由で申込みができます。
（実際にはNACCSと連携している植物検疫検査手続電算処理システム（PQ-NETWORK）を利用）


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・食品の輸入と販売
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食品の販売ですので、ネットの販売も基本的には実店舗の場合と同様に食品衛生法や自治体の定める条例により食品衛生責任者の設置、保健所の営業許可などが義務づけられます。
対象となる商品はお住まいの地域の条例（東京都の場合「食品製造業等取締条例」）により定められていますが、詳細を確認するにはやはり福祉保健局や最寄りの保健所に相談することをお勧めします。

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・ネット上での物品の販売
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届け出は必要ありませんが、サイトの開設に当たって特定商取引法の表示義務、個人情報保護指針(プライバシーポリシー)などを考慮する必要があります。