はじめましてwinkmo32さん
ご質問ありがとうございます。

膝関節の外傷でとくにアスリートの方々は靭帯損傷や滑膜炎症・軟骨変性など整形外科による専門外来の受診は正解です。

さて、受傷後3~5ヶ月で「痛み」が再現されるケースとしては以下の１～４が考えられます。

１、膝関節に病的変化が起こり滑膜包炎か膝蓋靭帯周囲の炎症または関節水腫
２、大腿四頭筋群等の筋力低下による関節負荷による疼痛
３、骨盤・股関節周囲の筋群不均等または機能的短下肢による関連痛
４、脛骨神経・総腓骨神経・伏在神経走行上のトリガーポイントによる関連痛

１の場合は外観上で健側と患側とを比較してください。また安静時痛・自発痛があります。
また腫脹・熱感もあります。この場合は必ず冷却剤の使用や冷シップ、安静にし様子をみて
場合により整形外科等の医療機関を受診してください。

２の場合、関節運動は徐々に行い、まずは関節センサーの役目である固有感覚受容器による反射を正常にする目的で筋等尺性収縮による運動をお勧めいたします。地味なトレーニング法ですが効果が高く再発率のリスク軽減いたします。

３のケースは膝関節の外傷等で重心移動の際の関節軸の変化や二次的な補正作用で機能的短下肢（1.3~2.2cm）となります。この場合は国際基準か容認されているカイロプラクティックでアクティベータメソッド・カイロプラクティックテクニックをお勧めいたします。

４の場合、は２や３の関連性があります。
レーザー治療かスーパーライザーという近赤外線による光線治療をお勧めいたします。

素人の方には１～４のどれに自身があてはまるか難しいと思います。
まずは３のケースで骨盤・下肢長分析をお勧めいたします。
All Aboutの専門家登録で健康・医療カテゴリ　国際基準のカイロプラクターが
何人もいらっしゃいますのでご相談されるとよいのではないでしょうか？

東京方面でよろしければわたしが力になれると思います。ご検討ください。

参考
http://www.iwasaki-laser.net