はじめまして、さおとめあきこ総合研究所の早乙女明子です。
よろしくお願いします。

ご相談の内容から、推測での記入となりますことご理解頂いた上でお読み頂けたらと思います。

横浜の建物を担保に入れ、資金を調達する場合、様々な不動産担保融資がありますから、ご自身のスタイルに適した商品を選ぶ必要があります。
借入額と金利のバランスを見極める必要があります。
貸してくれるMAX金額と金利との関係や、支払総額を検討して借入先を選ぶので、幾ら借りられるかは、その条件の組合せでいかようにも変わります。所有する物件の購入時の契約書や重要事項説明書や謄本などを金融期間に提出して査定してもらうことが具体的でしょう。

建物の価格については、賃料収入とのバランスを判断する必要がありますから、今後の収入予測を立てながら、建物に掛ける費用を検討します。
ご自身の資産状況やこれからの収入如何で変わりますから、近隣相場や一般的な平均値で判断するのは危険です。あくまで、ご自身の都合と世間との兼ね合いで、どの程度の規模の建築物が適切か、メンテナンスなどの長期修繕計画も含めて試算し、決めるのが良いでしょう。
土地幅が6.5mの縦長とのことですから、間取りや設計、デザインによって生きた物件にもありきたりな物件にもなる訳で、お近くの市場がどんな状況なのか、掛川市でのその土地の価値などを調査し、プランを立てるのが良いかと思います。
設計を工務店に依頼せず、設計士に依頼し、管理監修の業務委託をすれば、プロ目線で工務店とのやり取りを責任わ持って遂行してくれますから、専門家に委託することで手抜かり工事やミスを回避できます。
また、工務店の倒産などが心配であれば、行政機関でこれまでのトラブルや免許などについて閲覧出来ますし、保証機関への加入状況やその内容を事前に把握してから相談を開始します。

経費については、接道状況や公共の整備状態、建物の設計によって積算が変化しますし、賃貸の戸数によっても変わります。税制度や収入の具合で変わりますので、ご自身の場合はどうか？の判断をまず把握するのがよいでしょう。
世間との比較や一般論ではなく、ご自身のお立場ではどうなのか？を具体的に判断できる建築プロデューサーなどとの共同作業をお勧めします。