大変ですね。

干し梅様

大変な状況が伝わってきました。
以下、個人的な意見ですが、よろしければご参考になさってください。
顧問の税理士がいないと仮定します。
(顧問の税理士がいる場合は税理士にご相談されるのが一番です。)

1.まず取引業者に相談するのは良くないと思います。
　　相手を不安にさせたり、御社の情報が外にもれることになるからです。

　　売掛金や買掛金・未払金の残高について、確認されるのは
　　構わないと思います。ただ、先方もいい加減な経理をしていると
　　あてにならないので、不一致についてはお互いにチェックしあう必要があります。　


2.勘定科目や仕訳の方法など具体的に、これがわからないというものについては、
　　たとえば、こういったサイト等を利用してご質問されればいかがですか?

3.会計ソフトは導入されていますか?
　　導入されていない場合、会計ソフトの導入(購入)をおススメします。
　　もちろん最初は大変だと思いますが、たとえば弥生会計の場合は、
　　導入時の質問や操作等の質問等に対するサポートがあります。

4.御社は地元の商工会等に加入されていませんか?
　　そういった団体でも経理の相談にのってくれますよ。
　　

一生懸命お仕事をされてきて3ヶ月。最初の頃のミスが発覚し不安になっていらっしゃると
思いますが、たぶん、大変なピークは過ぎているのではと思います。がんばってください。