まだ来て3週目です。

1歳半でarukanaさんのお宅にきて、すでに「しーしー」の掛け声で排泄をしてくれて、優しくて温厚なんて良いコですね!!

2〜3ヶ月でお手元に来たのではなく、1歳半までブリーダーさんの所で育った訳ですから、環境が変わってワンちゃんが不安に感じるのは当然だと思います。
しかもブリーダーさんの元にいたのだとすれば、常に誰かが(親犬等)いる環境にいたはずです。
となれば、甘えん坊というより自分ひとりになることに慣れていないだけでしょう。

となれば、今行っていらっしゃる方法でワンちゃんがひとりでいる練習を積めば、必ず静かに留守番ができるようになります。

まだまだ来てたった3週間です。
18ヶ月間の癖をいきなり3週間で治そうと思わずに、もう少し待ってあげてください。

とりあえずは、クレートにガムなど気がそれるものを入れて、お出かけするようにしてみてください。
あとは、家にいるときに今やっているようにサークルにいれて過ごさせたり、後追いさせないようにしたりすれば良いでしょう。
※今はまだ長時間ではなく、コマめにひとりにさせる練習をすると良いかもしれません。

きっと他のことが良く出来ているコなので、留守中の吠えが突出して問題のように感じてしまっているのだと思います。
多かれ少なかれ、どのコも寂しくて吠えることはあります。
留守中の吠えをあまり気にし過ぎないようにしてください(^_^)