寂しいからと決めつける前に、するべきこと

マーキングの要因は寂しさなどよりも、未去勢である要因の方が大きいです。
まず去勢をなさることですね。

それと、一緒に寝ていたなどの文面から、赤ちゃんが来たことによって、当然犬に接するウエイトは変化しているはずです。生活パターンと何かしらが変われば、犬の行動は変化していきます。
それまでやっていなかった室内の排泄をたまたましてみた。したら出来た、気持ちよかった。犬はいいことが起きた行動を高め習慣化してゆきますから、室内でのマーキングが習慣化したと言うことでしょう。

食事は一番最後ということですが、食事の順番はかつては犬はオオカミと同じなどと言った現在では否定されている理論に導き出されていますので、あまり意味はありません。かつて私もそう指導していましたが、今は意味が無いと説明しています。

それとしつけが出来ているイコール、「待て」「伏せ」が出来るかどうかではありません。

飼い主と快適にお互いにストレス無く暮らして行ける術を犬に伝えるのがしつけです。それをしっかりとなさることです。

まとめますと、まず去勢、さらに犬への正しい理解、犬に何かを伝えるのはどうしたらいいかの正しい理解をなさるために、専門家のアドバイスを受けることです。

以上ご参考になれば幸いです。

※拙書「犬は知的にしつける」
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もぜひご一読下さい。いろいろ参考になるはずです。