業務上横領について

職場場の上司についての相談です。

私は小さなビジネスホテルにフロント・事務として勤めています。
小さなホテルなので、他に夜勤専門の社員（＝上司）と数名のパートがいるのみです。
この上司ですが、自分の受け持ちの時間でのチェックイン・アウト、つまり私に見られていないお客様についての売上の一部を着服しているようなのです。
毎日出力している「予約者一覧・滞在者一覧・精算者一覧」などの帳票では空室となっているのに、部屋使用のための清掃指示が出ているのがおかしいな？というところから気付きました。
調べてみると、該当の部屋について、お客様に名前を書いていただいた利用受付票が捨てられていることもしばしばです。
確信を持っていますが逆恨みされるのが怖いので、直接訊ねた事はありません。
また、この上司のほかには常駐の社員がいないので、誰にも相談が出来ません。
本社から各週で来る者もいますが、あまり面識が無いので言いにくいです。

金額的には月に２０万程度で、少なくとも私がホテルに来た半年前から現在も続いています。
捨てられた利用受付票など証拠になりそうなものは全て保管してあります。

業務上横領とは、誰からどこに告発するものなのでしょうか？
また、罪はどのくらいでしょうか？
悪いことだ、と思いつつも、その上司の勤務時間が仮眠を挟むとはいえ、１８時〜翌９時までで、お休みは週に１日。
それでお給料が２０万程度なので、やってられない！と思ってのことかも知れませんが、それとこれとは別なことですよね。

このまま放置するのも、見て見ぬふりをするのも心苦しいです。
私はどうすればよいでしょうか？

拙い文章で申し訳ありません。
不明なところは補足いたしますので、おっしゃってください。
よいアドバイスをお願いします。