根充あとの激痛とその後の治療ついて。

再根管治療中です。
8日に、右下7番の根っこの洗浄（膿みが出ている状態でした）をし、
同日、根充治療も行いました。
ちなみに、再根管治療ははじめてです。

根っこの消毒、根充も激痛でした。そして帰宅すると更に痛みがひどくなり、
処方されたジクロフェナクを服用しました。
眠れぬ夜を過ごしました。
翌朝、問い合わせをすると、我慢できなければ抜歯、（後日確認すると、
やり直しの治療はもっと痛いから抜歯のほうがよい） と言われました。

フレアアップだったのでしょうか。根充後4日目から鎮痛剤を服用しなくても
過ごせるようにはなりました。が、現在もズキズキする痛みは残っています。
掛かりつけ医は、レントゲンはきれいだから絶対に痛くなくなる、と
おっしゃいますが、掛かりつけ医が予測する「痛みが消えるまでの日数」が
どんどん伸びて、もやもやします。
数日後、痛みが残っていても土台を立て型取りをするようです。

また、右上6番も根管治療中、土台を立ててあります。
触ると痛みがある状態で、型取りをしてから12日が経過していました。
掛かりつけ医から、間をあけるとクラウンが入らなくなる、とのお話があり、
二日前に銀クラウンを被せました。クラウンを被せてしまえば痛みが消える、
とのことでしたが痛みは引きません。

咀嚼を片側で行っているため、あごも鳴るようになりました。

引っ越しのため転院したばかりで、諸々不安です。
治療していただき感謝をしているのですが、このままだと
抜歯になりそうで気が重いです。
このまま現在の医師にお任せすることがベターでしょうか。

前を向くための励まし、ご助言を、どうぞよろしくお願いいたします。