ご質問の件

宇佐美と申します。プランニングのみを別会社でと言うことは少なからず問題があると思います。
先ず建物はプランだけでは造ることはできません。そのプランにマッチした構造や設備・外装・インテリア・法基準と言った要素を総合的にまとめて設計図書を作成(実施設計と言う)する必要があります。ハウスメーカー(以下HM)にプランのみを渡してその後の実施設計と施工を依頼すると言うのはHM側が躊躇するかもしれません。仮に納得したとしても工事費が割高になる可能性がありますね。またこのようなケースでは万が一建物に問題が生じた場合に責任の所在が不明瞭になる可能性もあります。
責任の所在を明らかにする為にもプランのみを外部に依頼するのではなく設計監理まで一括して設計事務所に依頼することをお勧めします。(HMが納得すればですが・・・)これにより設計と施工が明確に分離されるので責任の所在がはっきりします。
ただ上記のような結論を出す前にもっとHMのデザイナーと話し合って納得できるプランを出してもらい設計施工で契約するのがベターだと思います。担当のデザイナーを変えてもらうこともできるはずですし　HMに協力事務所があれば紹介してもらうことも可能でしょう。この場合はHMが設計したことになるはずなので責任の所在は明らかです。
素敵なお家ができることをお祈りしています。以上ご参考まで。