慎重に検討してください

ru-さん、はじめまして。
志田建築設計事務所　志田です。

ご質問の件は、とても慎重に検討する必要があります。

　　最初2階建て、将来3階建てに増築

これをやる場合、最初から3階建てとして構造計算しておかなければなりません。
構造、内装ともに、3階建て仕様としておく事も必要でしょう。
2階建てと3階建てでは、建築基準法での対象が変わってきますので、どうするか、きちんと考えておく必要があります。そうでないと、「将来増築」は、昨年改正された建築基準法では、かなり大変な事になってしまいます。・・・3階建てを、とお考えなら、最初から3階建てで考え<3階建ての建築確認を出す>事をお勧めします。

また、2階建て仕様か　3階建て仕様か　では予算も変わってきます。
根本的なところなので、今はっきり方針を決められるほうがよいでしょう。

将来のお子さんのために　2階建て+ロフト　という考え方もあります。ロフトは、天井高さ1.4mまでですが、お子さんが小さいうちは十分ですし、その先は、寝室を子供部屋とし、ロフトをご夫婦の寝室とする、という事も考えられます。

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私も今、とても小さな敷地の3階建ての家　をやっていますので、むずかしさも十分わかります。でも考え方ひとつで、小さな家でも、楽しい家になります。
ru-さんがお話を進めている方がいらっしゃるなら、法規の事含めてよくお話されて、楽しい家　を実現してくださいね。