それぞれにメリット・デメリットはあると思います。

こんにちは。
キャリアカウンセラーの齋藤めぐみです。

「違い」が求職者さまから見たことなのか、採用企業から見たことなのか
上記からは判断できなかったので、両方書きましたので、
読みにくくて申し訳ありません。

求職者から見ての差という意味では、
○人材紹介の場合
人材紹介会社に登録すると、キャリアアドバイザーによる無料相談があります。
かつ、求人媒体や自社採用ページにない「秘密求人(非公開求人)」があるので
選択肢が広がるかも知れません。
かつ日程調整、年収の交渉など企業との連絡は人材紹介会社さんがやってくれるので、
忙しい方には、効率よく転職活動する方法だと思います。

○自己応募の場合
キャリアアドバイスなどを受けられないので、自分で棚卸しをし、
履歴書・職歴書などを作成して応募しなければなりません。
かつ自分で探せる範囲の求人なので、新しい発見や非公開求人に
出会うことがないというデメリットもあります。
メリットとしては、自社求人サイトでエントリーすると、
企業側に、志望意欲の高さをPRできます。

そして、私が人事のときの経験からですが、
求人企業側から見ると、コストが低い採用方法を
どうしても選びたい!というのもあると思います。

人材紹介会社は成功報酬、自社採用サイトは無料、求人広告媒体は広告料を
採用できてもできなくても支払うといったように、コストが変わるので、
企業さまによっては、変わることもあります。

もちろん、最近の求人バブル(売り手市場)ですと、
お金がかかっても「優秀な人材」を採用したいという企業さまが
多いとは思います。

基本的にはご自身の転職活動のスタイルに合わせて
選択するとよいと思いますし、併用してもよいと思います。

「転職活動の仕方」自体がよくわからない方は、一度人材紹介会社に
ご登録されると、キャリアアドバイザーが教えてくれますので、
ぜひ一度、ご登録されることをお勧めいたします。