世帯主と扶養者は異なる場合もあります。

はたらくはは様

はじめまして。ファイナンシャルプランナー＆カウンセラーの杉浦と申します。
突然「どちらの扶養にするか決めてください」と言われて決めかねているご様子ですね。

共働きのご夫婦で、お子様が２人以上いらっしゃる場合、
（１）健康保険の子供の扶養は、どちらか１人の扶養となります。ご夫婦で収入の多い方の扶養とするのが一般的です。
（２）所得税等の税金の扶養は、別々の扶養とすることもできます。
（３）家族手当は会社の規定によります。よって、ご夫婦のお勤め先でそれぞれルールが異なることがあります。
（４）(1)～(2)は住民票上の世帯主とは関係がなく、お子様を世帯主でない方の扶養とすることもできます。

ご主人の会社の家族手当のルールが「子どもが複数の場合、全員を扶養家族とした時のみ家族手当を支給する」と変わったような場合は、どちらかの扶養に決めないとご主人は家族手当を受け取ることができなくなります。
また、最近は減ってはきましたが「住民票の世帯主にのみ家族手当を支給する」というルールがある企業もあります。

まずご主人の会社の総務部等に、なぜ扶養を分けられないと言っているのか（(1)～(3)の理由か、それ以外か）をご確認されたうえで、主にお二人のお子様を扶養しているのはご夫婦どちらなのかを、ご夫婦で見極めていただき、申請されるとよろしいかと思います。