持分移転と住宅ローンの扱い

ご質問の事例では，まず，８００万円で弟さんから物件の共有持分を買い取り，弟さんはその８００万円を金融機関に弁済する，その後の残債務については，おそらく住宅に抵当権がついていると思われますから，その抵当権がzeamiさまのもとへ移ってきますので，原則としては弟さんが支払いを続けるが，万一のときはこちらで支払わなければならないというのが一般的と思われます。法的手続としては，単に当方が抵当権のみ負担する方法と，併存的債務引受（銀行に対し，自分も債務を引受ける旨の意思表示をする）といって，当方も法的に弁済の責任を負う方法とがあります。この場合，弟さんには譲渡所得税が発生し得ますが，おそらく，取得価格に較べ売却価格のほうが低いので，結論的にはゼロでしょう。zeamiさまには不動産取得税が若干課税されます。また，この売買が時価より低い価格でなされたと税務署がみた場合には，贈与税の課税対象となる可能性がありますから，適正価格で譲渡をしなくてはなりません。
今回を機に抵当権を消す方法としては，抵当権消滅請求というものがあり（民法３７９条〜），こちらが売買代金の８００万円を金融機関に払うので抵当権を抹消しろといえます。この場合，２ヶ月以内に金融機関が抵当権を実行して競売の申立てをしないと，８００万円を取得するかわりに，抵当権は消えることになります。しかし，場合によっては競売されてしまう可能性もあるので，かなりギャンブル的な手続ではあります。ご参考まで。