同じトーンで揃えるのが良いと思います。

KR様

LDKの壁全体を黄色にすると、薄いとはいえ、思ったより、「黄色」という印象が強く出ると思います。
ナチュラルバーチは、白木系と書かれているので、白い着色ではなく、着色していない自然な風合いの物かと思います。
黄色と白木は、トーンが似ているので、ぼやけるというよりも、馴染む感じになりますので、良いと思います。

むしろ、天井と巾木がどの様な色なのかが気になります。
床と壁（フローリング）は、明らかに素材が違うので、違う色を組み合わせたり、トーンを揃えたりといった、いろいろな考え方ができますが、天井と巾木は、壁と直接接して、しかも同じ様に見えてきます。
黄色い壁はクロスでしょうか、それとも塗装でしょうか？
どちらでも色は自由に出来ますが、天井は同じ仕上げに揃えるのが良いと思います。

天井は白くしてしまうことが多いですが、壁に色を付ける場合は、揃えた方が部屋の雰囲気にまとまりが出ます。
また、巾木を床に合わせて白木系にするか、それとも着色をして壁と同じにするかで、大分部屋の雰囲気が違います。
どちらでも大丈夫ですが、白木系の方は部屋全体がナチュラルな印象になり、黄色くするとモダンな印象になると思います。
巾木はクロスにはできないので、巾木を塗装しても、壁がクロスの場合は違う仕上げに見えます。
壁が塗装の場合はまったく同じ色にすることもできます。

また、柱についてですが、「丸太だけがイメージが違う」とお書きになっているので、部屋全体は、ナチュラルもしくはナチュラルモダンな空間を目指されているのだと思います。
この丸太が直径30cmなのか、15cmなのかで生かし方は大分違いますが、いずれにしてもダークブラウンではちょっとコントラストがきついので、壁や建具のトーンと合わせて、白く塗って、あまり主張しすぎない方が良いと思います。

以上で回答になりましたでしょうか。
良いリフォームとなることを心よりお祈りいたします。